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Durante os dois primeiros anos com o novo credenciamento, que possui prazo de 5 anos, a Instituição vem cumprindo metas. Entre elas, manteve os programas de mestrado em Biologia Parasitária e em Odontologia. Participa de duas redes de pesquisa com outras Instituições de Ensino Superior (IES) da região Norte (Rede Amazônica de  educação em Ciências e Matemática – REAMEC e a Rede de Biodiversidade e Biotecnologia da Amazônia Legal – BIONORTE), as quais possuem dois doutorados vinculados:  doutorado em Ensino de Ciências e Matemática e o Doutorado em Biodiversidade e Biotecnologia, respectivamente.

Ampliou a oferta da pós-graduação stricto sensu por meio de mais um curso de mestrado: o de Gestão de Programas e Serviços de Saúde. Fortaleceu grupos de pesquisas cadastrados no CNPq; favoreceu a inclusão de docentes pesquisadores vinculados a agências de fomento, a exemplo da Fundação de Amparo à Pesquisa e ao Desenvolvimento Científico e Tecnológico do Maranhão – Fapema, que só nos 3 primeiros meses de 2014, mais de 15 projetos de professores da Instituição foram aprovados em editais. Cumpre destacar que o Pró-Reitor de Ensino, Pesquisa e Extensão da Universidade Ceuma, Prof. Dr. Valério Monteiro, a Prof. Dr. Cristina Loyola, a Professora de Jornalismo, Josie Bastos e o estudante do curso Sistemas de Informação, Arão Alves de Farias, orientado pelo Prof. Dr. Will Ribamar Mendes Almeida estiveram entre os vencedores do Prêmio Fapema 2013.

Aumentou a quantidade de professores Mestres e Doutores. Recentemente, cinco docentes do Curso de Odontologia foram aprovados no processo seletivo para cursar o Doutorado, e a quantidade de horas dedicadas à atividade extraclasse (pesquisa, extensão, orientação etc) é expressiva.